تضم حديقة حيوان الجيزة، متحف محنطات لحيوانات بعضها نفق في الحديقة قبل أكثر من مئة عام. وتُعرض في المتحف، الذي يتألف من ثلاثة طوابق، محنطات للمئات من الثدييات والزواحف والطيور والحشرات. ويفخر المتحف بأنه الوحيد في الشرق الأوسط وأفريقيا الذي يعرض محنطات لحيوانات نادرة وحتى منقرضة مثل غزال أبيض كان موجودا في مصر قبل مئة سنة، ونمر مصري كان يعيش في سيناء وغير ذلك من الطيور.
وتوجد مثل هذه الحيوانات النادرة في الطابق الثاني من مبنى المتحف الذي تضم فيه القاعة الرئيسية بالطابق الأول بقايا عظمية محنطة لحيتان وزرافات وقرود، كانت كلها تعيش، قبل نفوقها، بحديقة الحيوان التاريخية بالجيزة. وقال محمد رجائي، رئيس الإدارة المركزية لحديقة الحيوان بالجيزة، "تقريبا توجد بالمتحف محنطات غير موجودة حتى في اشهر المتاحف،
كما أن ما يميز المكان وجود محنطات لحيوانات كانت تعيش بالحديقة ونفقت من 1910 و1920، بالإضافة إلى الحديقة التي تعتبر أقدم حديقة في كامل المنطقة وثاني حديقة في العالم. فالحيوانات التي بحوزتنا حيوانات نادرة ومنقرضة" ويعرض المتحف مجموعة واسعة من الحيوانات، جميعها تم حفظها كما هي من خلال عملية تحنيط بالغة الدقة، وجرى إنشاء المتحف الحيواني في عام 1906 وتعرّض للإغلاق 3 مرات في تاريخه أولها عام 1962 ثم عامي 1988 و1998 بسبب الإهمال.
وكانت حديقة حيوان الجيزة ذات يوم بمثابة جوهرة تاج حدائق الحيوان الأفريقية، لكنها تعاني من مشكلات في السنوات الأخيرة، وجرى إنشاء الحديقة بتكليف من الخديوي إسماعيل وافتُتحت عام 1891 لتعرض فيها زهور مستوردة ونباتات غريبة ولتصبح بمثابة معرض ضخم للحياة البرية الأفريقية.